Hola Edmo.
Nosotros tenemos dos gupos de dos baterias como las que tienes tu,se cargan perfectamente con un unico alternador que no es de coche pues es el que traia el motor un volvo de 140 cv y carga bastante mas que uno de coche por lo que si hay alternadores que te cargaran tus baterias sin problemas,tambien te puedes plantear el montar dos alternadores aqui hay muchos barcos que los lleban.
Si que acumulan carbonilla y es perjudicial pero no te preocupes,nuestro motor echa cada dia 5-6 horas al ralenti tiene 15 años y nunca dio ningun problema por ahi eso si de vez en cuando metele un poquito de caña para que escupa toda la carbonilla y listo.
Tambien te puedes plantear poner un panel solar o un aerogenerador no se ahora tienes muchas posibilidades otros cofrades te informaran mejor,suerte y un saludo.