¿Que las estas probando en Ubuntu? ¿Navigatrix? ¿te fallan en ambas?

Si te fallan en ambas es que alguna parte no se descargó bien. O puede que al descomprimir algún archivo se dañara.
Descargarlas de nuevo del enlace original y pruébalas.

Si... ya se que da pereza pero... es lo que hay.

EDito para añadir....

¿Le has indicado a opencpn especificamente la nueva carpeta de cartas? Lo digo porque meterlas bajo la carpeta superior no siempre funciona aunque el nivel superior si este incluido.
¿Has probado a renovar la base de datos? Si no estan dañadas tiene que funcionar.