El cambio del colector de escape para nada tiene que influir en la compresión.
Prueba a purgar bien el motor quitando los inyectores y dando al arranque. Si cuando tengas el motor bien purgado no arranca, sería para mosquearse.
Por cierto, si el motor lleva calentadores, conviene revisar que están en condiciones. Al igual que su relé.

