GvSig es un software de Sistemas de Información Geográfica que te permitiré hacer esos cálculos. Puedes cargar el pdf y operar sobre él. Ahora, quizá tengas que escalarlo adecuadamente.
Hace tiempo que no lo uso pero no era difícil de utilizar (aunque no es un Paint). Lo puedes descargar aquí:
http://www.gvsig.org
