Hola,
No te equivocas; en el centro del país está la mayor población y la con mayores recursos. No obstante, hay marinas o clubes de yates en:
Arica, Iquique, Antofagasta, La Serena, Valdivia y Puerto Montt.
También hay caletas de pescadores, con fondeos decentes en casi todo el litoral. Por otra parte, te recomiendo mirar la zona de los canales y fiordos, al sur de Puerto Montt. De hecho, con un amigo estamos preparando un yate de aluminio en Puerto Aysen, con la finalidad de traerlo por mar hasta el club de yates de Viña del Mar.
Un abrazo y
Alberto