En estos casos lo mejor es asesorarse, pero yo pasaría de las gestorías, acaba siendo más rápido y económico que lleves tú el papeleo y los trámites que es bastante sencillo. Otra cosa es lo que tardan en tramitra las cosas los/as chicos/as de capitanía.
Pero ojo!!!!! que en octubre entra el nuevo reglamento en funcionamiento, mucho cuidado con esto.
Aunque es cierto, que en tu situación, aunque hagas los papeles o trámites tú mismo, te va a tocar pasar por las manos de un ingeniero.
Como dije, es mejor asesorarse, y te recomiendo el siguiente despacho de ingeniería:
http://www.telefonica.net/web2/ingenierosnavales
También tienes a otro ingeniero naval que de vez en cuando se meniona su web, y alguna cosa tiene hecha para algún cofrade de por aquí, según creo haber leido (pero me parece que está integrado o trabaja ahora con los del despacho de arriba):
http://rvelasco.iies.es
Luego tienes la página del ministerio de fomento, sección marina mercante, que ahura tiene mucha información sobre estos temas. Y sino ya sabes, envia un mail a los ingenieros, ellos ya te contarán e indicarán precios.