Hola Tam, que me corrijan los expertos si me equivoco.
Se pone en automoción ( coches, caravanas, camiones, etc... ) en el negativo porque si hay algún problema con el desconectador derivará a masa, sin provocar accidente alguno.
Tambien porque hay formatos de desconectador que solo tienen un terminal y es el propio desconectador el que hace contacto con el chasis que es el negativo, la masa.
En los barcos no hay chasis

entonces se puede cortar el positivo, el negativo y los dos a la vez. Yo conozco los tres casos.
La idoneidad de hacerlo de una u otra forma, ya no tengo conocimientos para ello.
Damos por hecho que hablamos de desconectadores manuales. Ten en cuenta tambien que en náutica, en esloras de cierto tamaño, no se usan sino que se montan eléctricos y cortan el positivo normalmente.
Hay tantos modelos de desconectadores que se podría escribir un libro y combinaciones en instalaciones para aburrir.
Uno de los más comunes es el de rueda, que como todo el mundo sabe es desconectador y selector.
Seguro que no te he despejado la duda, pero creo que por ahi van los tiros

