La verdad es que nunca me lo había planteado.
En mi barco tengo todos los negativos conectados entre sí y todos los positivos son los que pasan por fusible, relé o desconectador.
La masa del barco está conectada al palo y a la orza de hierro, lo cual creo que es una masa/tierra fantástica, especialmente si cayese un rayo.
Me parece la configuración más lógica desconectar todos los positivos, pero, a priori, sin darle muchas vueltas, tiendo a verlo indiferente. A final, se trata de interrumpir un circuito cerrado con una diferencia de potencial en bornes de la batería, y tiendo a pensar que da lo mismo en qué punto del circuito se haga o que sentido tenga la corriente (en el caso de alterna esto resulta especialmente claro).
LDN