En mi opinión,
legalmente, es el responsable de lo que ocurra, al barco y a los tripulantes, en ambos casos.
La lógica me dice que solo debe serlo en el primer caso, pero lo lógico y lo legal no suelen ir juntos...

y siempre habrá quien diga que es responsabilidad del patrón poner los medios para evitar acciones indebidas por parte de los tripulantes...
En cualquier caso, es solo mi opinión, no sé como estaría la cosa en el segundo caso.