A todas las opiniones que te han dado ya, yo añadiría una más que te evitará estar pendiente del selector según vayas a motor, o navegando a vela o fondeado.
Gasta algo de pasta (creo que menos de 150 €) y pon un repartidor de carga. A el van conectados como entrada, tanto el cargador como el alternador, y como salida, siempre están conectadas las dos baterías que tengas, pero de forma separada. Así, siempre que navegues o estés en puerto, tendrás la seguridad de que las dos baterías están cargando correctamente. El dichoso selector (1, 2, 1+2, off) solo tendrás que accionarlo cuando un día por lo que sea te quedes sin batería de motor y quieras hacerlo funcionar a través de la de servicio, o viceversa; o las dos juntas si es que las dos andan bajitas de carga.
Con ello, siempre llevarías el selector en "1" o en "2" (dependiendo de como conectes), y no tendrías que tocar nada salvo emergencia
Espero haberme explicado bien
