Ojala todos los bricoproblemas fueran asi de graves jeje 5mm no es tan pequeño puedes como te han dicho ir empujando la masilla con la espatula y ayudandote de un palito o similar o comprar una jeringuilla gordota sin aguja y rellenar o llenar con silicona o resina mejor pero ,mas dificil de conseguir y tapar con masila el ultimo tramo.
edito:La ventaja del epoxi no es su mayor cualidad de impermeabilidad?
saludos.