Frantxu, una solución como la que comentas la he visto en varios modelos del astillero Swallowboats. Puedes echarle un vistazo a su web, aunque no me parece que se aprecie con claridad. Son unas láminas elásticas de Mylar que cierran el pozo del fuera borda. Tienen la resistencia suficiente para impedir las perturbaciones del agua. Al bajar el fueraborda, se abren abrazando el eje. Lo he visto en otros modelos, con variantes. Pero en general, si el fuera borda se puede abatir para que salga del agua, como en mi barco, los cierres del pozo son rígidos, de laminado o de poliester.

http://www.swallowboats.co.uk/content/view/191/132/