No hay que alarmarse en principio, pero relatas dos síntomas que hay que analizar con cuidado.
1) Madera podrida. Significa que tienes filtraciones por algún sitio. Si es así (parece serlo) mira si hay "goteras por debajo de la cubierta y sobre todo si coinciden con la unión casco/cubierta. Quizás deberás mirar por el interior de los armarios y desmontar alguna tabla. Las filtraciones no tienen porque ser terribles de por si, pero presagian problemas futuros si es que no los tienes ya.
2) Cadenotes: Dices que una tuerca estaba totalmente podrida; señal de que hay humedad donde no debería. No te conformes con poner tuerca nueva. Hay que averiguar que es lo que ocurre.
Quizás una foto de los cadenotes y de la zona inferior de la cubierta que coincida con los obenques nos ayudaría a dar opiniones mas fundadas.
