No sé si entiendo muy bien lo que quieres decir, ni si te servirá lo que te diga...
Por contexto, intuyo que el barco sería para usar en España, y que lo abanderarías en España...
Hay algún hilo por ahí de "autoconstrucción" que seguro te ayuda.
Que yo sepa, más de 2,5 metros, en España habría que matricular.
El procedimiento, en esta web de la DGMM:
http://www.fomento.gob.es/MFOM/LANG_CASTELLANO/DIRECCIONES_GENERALES/MARINA_MERCANTE/NAUTICA_DE_RECREO/Documentos_administrativos/Matricula_de_embarcaciones/
(tienes que mirar en abanderamiento y en Matrícula, por lo menos)
Respecto a la segunda pregunta, cuando se habla de eslora, se habla de eslora total (length over all), si no estoy equivocado...

