Bueno, como al final el plan de navegación ha cambiado, iremos explicando como instalarlo del modo apropiado.

Lo primero:

Nunca se deben instalar los datos de usuario (lease /home) en la misma partición que el sistema. Es un rollazo y crea los problemas que te han surgido.
Sí, ya se que todo el mundo lo hace........ Mal.

Tando en Win como en Linux se pueden y deben crear particiones separadas por seguridad.

Al instalar ubuntu hay un momento en que el instalador te pregunta si quieres sustituir un sistema por otro o instalarlo junto o eliminarlo Etc. Este es el momento para escoger la opción para hacerlo manualmente.

Al escoger la opción manual nos metemos en conocimientos medios pero qu creo que casi todos los usuarios pueden manipular si lo hacen con cuidado.

Lo primero Ketih11 copia en un disco externo tus archivos personales (fotos, vídeos, mapas Etc). Te recomiendo eso mas que copiar la /home en si pues puede que copies una barbaridad de basura como archivos temporales de Internet y cosas así. Salva lo mas MAS importante.... tus cosas. Perderás configuraciones de programas y tal pero tu instalación sera realmente limpia.

Cierto, también podrias usar un usb para arrancar, y con gparted modificar el tamaño de la partición que tienes en el disco. Dejar espacio vacío y reparticionarlo. Toda esta tarea te podria permitir salvar tu /home sin tener que copiarlo previamente. Pero tiene el inconveniente de ser mas complicado y de que si algo va mal lo perderás todo. NO lo recomiendo