Gnuais no lo veras ya que no tiene "iconito". Si usas Navigatrix con la version original de opencpn (2.5.0) deberia funcionar sin mas.
En Navigatrix el icono de opencpn apunta a un guion que pone en marcha gnuais y despues inicia opencpn.
Lo de las ondas es para ayudarte a ajustar correctamente los niveles de audio pues si son excesivos o muy bajos no funcionara.
Si has actualizado opencpn el AIS no funcionara. Si los ajustes de audio no son correctos no funcionara. Si la salida de discriminador no esta bien hecha no funcionara.
Esto te lo digo sin siquiera haber probado esto personalmente pues no dispongo del equipo adecuado.

Suerte con el tema.