¿Instalaste un Ubuntu con Unity? (ese escritorio un tanto raro)

Insisto... es algo lento para un Atom.

Deberías haber probado Lubuntu, mismas prestaciones, escritorio ligero. O mejor aún Navigatrix, mismas prestaciones, escritorio ligero y opencpn y Zygrib ya instalados.

Descárgalo, mételo en el pendrive y pruébalo sin necesidad de instalarlo. Si te parece mas rápido cámbialo. Si no.... quédate como estás.

Pero Ubuntu con unity es el último que recomendaría para un Atom con 1 Giga de Ram.