Pues no me ha dado esa opción de sustituir el antiguo por el nuevo y finalmente he acabado con tres sistemas operativos. Navigatrix 0.5 se ha instalado en la partición Linux creando sus propias particiones.
Solución: he arrancado desde el DVD y con GParted he eliminado todas las particiones Linux y después he vuelto a ejecutar la opción de instalar en disco duro. Ahora sí. El instalador solo detecta WXP (obviamente) y al elegir la opción por defecto de instalar junto a WXP, crea sus particiones usando todo el espacio sin asignar (las particiones borradas)
¡Solucionado!
