Te cuento mi experiencia, yo realice ese mismo trabajo hace años supervisado por un mecánico dedicado a la náutica. Para realizar el trabajo bien hay que hacerlo fuera del agua por un motivo, la bocina tiene un diámetro interior superior al diámetro exterior del eje, por lo tanto hay que fabricar un casquillo de nylon diámetro exterior el de la bocina,diámetro interior el del eje con un labio para que no se cuele por la bocina. Sacas el plato del eje, colocas el casquillo en la bocina vuelves a montar el plato en el eje, ahora ya tendrías alineado la entrada del eje en el casco con el arbotante, ahora solo te quedaría ir moviendo el motor para alinear el plato que esta en la inversora con el del eje. Cuando casen perfectamente y no hay luz entre ellos ( lo puedes hacer con galgas) desmontas de nuevo el plato del eje, sacas el casquillo de nylon vuelves a montar el plato del eje y ya lo tienes alineado.