Gracias por vuestras respuestas.
Mirando la documentación del SmartPilot S2 veo que las salidas de NMEA únicamente transmiten los siguientes datos: BWG, GLL, HDG, HDM, HDT y VTG
Por tanto, es normal que no reciba datos de los equipos de viento/profundidad y tendré que buscar otra forma de transmitir los datos de esta instrumentación vía Wifi.
Me sigue quedando la duda de porqué al conectar el el piloto al AIS, este desconecta la transmisión de datos...