Sin duda pon regulador con tecnologia MPPT. La instalacion es muy sencilla. 2 cables que vienen de las placas y entran al regulador. Y la salida a las baterias en paralelo.
Si puedes instala tambien un separador electronico para distribuir la carga entre las baterias de servicio y la de arranque.
Si en servicio solo usaras dos baterías, las pones en paralelo y entras en la que mas cómodo te vaya. Si tienes mas. Siempre en el centro. Otra opcion es conectar polos y baterias opuestos, aunque no tengo comprobada su ventaja.
Pon buena sección de cable para todo. En 12 V las caidas son importantes. De las placas al regulador como minimo te recomiendo 6 mm.
Tambien es importante que las baterias sean del mismo tipo y que tengan la misma antiguedad (las que van en paralelo) La de arranque puede ser de otro tipo.
Mira los reguladores de esta gente. Tiene unos precios imbatibles y te lo envian a casa muy rapido.
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Ya contarás.
Un saludo.