El regulador de 40 A lleva en prueba desde hace 6 meses con un uso intensivo (24 hs funcionando), y sin ningún problema.
Cuidado con esta última afirmación que haces porque creo interpretas mal lo que escribí.
Poner las baterías en paralelo, no tiene nada que ver con que la carga se reparta a las que mas lo necesitan, o mejor dicho, de forma independiente a una o a otra. Esto solo se logra con un separador de baterías (de diodos o electrónico)
Te hago un esquema MUY BÁSICO Y SIMPLIFICADO para que se entienda.
Saludos