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Pues ahora que comentas lo de x11vnc puede que tu solo te hayas contestado. Creo que el culpable puede ser xrdp ya que cuando lo instalaba me condenaba a usar el sistema siempre remotamente ya que mi adaptador HDMI-VGA dejaba de funcionar.
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Me sorprende ya que xrdp parece que es totalmente independiente de la pantalla de inicio principal. No puedo añadir mas ya que apenas empiezo a conocerlo, ni tampoco uso adaptador HDMI_VGA y estos son algo particulares. Pero..... en principio me sorprende
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Para que inicie openbox directamente ejecuta:
sudo update-alternatives --config x-session-manager y elige el entorno grafico por defecto. O simplemente deslogueate y vuelvete a logear seleccionando openbox como entorno y hasta que no vuelvas a seleccionar lxde, siguiendo el mismo proceso, openbox se ejecutará siempre por defecto. Esto quería explicarlo cuando publique la imagen pero se me olvidó 
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Lo de sudo update-alternatives --config x-session-manager se me habia pasado. Evidentemente si conocia la opción de cerrar sesióm y elegir escritorio. Simplemente desde xrdp no sirve pues no inicia sesión sobre ningún
display manager sino sobre uno particular de xrdp que no da opción a usar otro mas que el escritorio que viene por defecto.
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Al hilo de esto último te comento la razón de no eliminar lxde ni los paquetes de programación. Basicamente la intención es conservar la esencia de la Pi como entorno de aprendizaje, investigación y desarrollo pero a la vez crear nuestro plotter alternativo y mejorado y facil de usar por cualquiera sin conocimientos de linux. Resumiendo... la imagen se entrega con openbox por defecto, es decir el entorno que la gran mayoria de nosotros usaremos en el barco sin acceso facil a los extras, ligero, sin distracciones y quizás mas importante, sin la posibilidad de trastear con el sistema y volverlo inestable. Pero... el usuario con conocimientos y con curiosidad podrá usar la Pi tal como sale de fabrica solo con deslogearse y volverse a logear en el entorno lxde. Será como estar en otro ordenador completamente diferente.
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Hay un detalle que debes tener en cuenta, y es que estos paquetes (sobre todo wolfram) se actualizan con relativa frecuencia y si estas de viaje tirando de móvil se pueden pulir un buen bocado de tu tarifa de datos si te descuidas al actualizar.
Ademas yo desaconsejaria usar una misma SD para cacharrear y experimentar y al mismo tiempo usarla del modo SailPi. Prefiero dos separadas.
Las SD tienden a desgastarse al reescribir datos con relativa facilidad y si queremos que el sistema sea fiable cuanto menos se desgaste mejor. Por ejemplo yo uso una exclusivamente para las compilaciones. Otra solo para navegación y otra para experimentos y/o xbmc cuando apetece.
Arrancar con otra tarjeta es casi tan rápido como cambiar de sesión.
Me alegro de que te hayas puesto en serio con python. Algo de programación de la buena hacia falta para pulir esos detalles.
Por cierto, lo de poner la hora con el gps usando el modo que propusiste va de perlas.
Lo puse en el crontab y ni una sola de las veces que inició la Pi falló. Al final deshabilité ntpd.