En este mensaje
http://foro.latabernadelpuerto.com/s...58#post1744958
puse este esquema:

para hacer la instalación del Adverc.
Adaptándolo a lo que tienes tú, te quedaría esto: (es una de las muchas posibilidades que hay). Esto funciona perfectamente, es simple y te resuelve la mayor parte de los problemas.
Edito: No creas que me estoy contradiciendo. Puedes quitar el cargador de baterías de donde está en el esquema y dejarlo como lo tienes: lo conectas a la batería que tengas más a mano y pones el selector en both, cosa que tienes que hacer también con lo que hay en el esquema, pero ese circuito te permite cargar una, la otra o las dos a la vez, con el cargador Y/O con el alternador.