Buenas, barbacanosa y gracias por los tragos
Yo me he adjudicado un barco en una subasta de la EPPA, el iva te lo aplican en el momento de la adjudicación y es el 21 % del precio de adjudicación, es decir que si pujas por ejemplo 1000 €, tendràs que pagar 1210 €.
En cuanto al impuesto de matriculación, tendràs que pasar por la delegación de hacienda y abonar el impuesto correspondiente (creo recordar que es el 18% sobre el valor de adjudicación sin incluir IVA, es decir 180 € en el ejemplo anterior)
Creo que el barco que comentas ya está matriculado en España, por tanto no tendrías que pagar impuesto de matriculación ni tendrás problemas con el abanderamiento
Mi barco tiene certificado de Antigua y Barbuda, de momento he pagado los impuestos correspondientes y no he tocado el tema de la bandera, cuando me paren y me digan algo ya empezaré a mover papeles

Mi recomendación es que pongas una cantidad muy pequeña, ridícula, de manera que si no te merece la pena arrglarlo, puedas recuperar el dinero vendiendo el desguace.

Espero haberte sido de utilidad
suerte