No anules los diodos (led) seguramente formen parte del circuito y tendrías que desoldar y poner un diodo normal en su sitio. el Led de por si no te descarga la batería en ese tiempo, si son de 1w tendrán un consumo de 250-300 mA como mucho y eso no es suficiente como para descargarla, podrías tener alguna fuga por algún sitio, una mala conexión... cualquier cosa o incluso la batería viciada por haberle dado malas cargas.
Respecto a las baterias "marinas" no estoy muy por la labor pero cada uno se gasta los cuartos como quiere, ahora bien ya que te los gastas planteate poner al menos 2, una de arranque para el motor y otra de servicio de ciclo profundo (gel, agm) que admiten descargas muy acusadas y un buen rendimiento.
Un saludo y otra rondita