Hola Marsalad.
Tenía entendido que no tiene mucho que ver un piloto automático para caña con uno para rueda. De hecho Raymarine (ex Rayteon) tiene un manual de instrucciones diferente para cada uno de ellos.
Aquí:
http://www.raymarine.com/view/?id=1836 puedes encontrarlos.
El problema que planteas parece que procede del fluxgate (compás electrónico)
Podría estar averiado o (a veces ocurre sin darnos cuenta) pusiste algo metálico cerca del fluxgate que afecta magnetismo del mismo, por lo que este no marcaría el Rº verdadero.
Saludos
José