Tienes que hacer dos cosas, tramitar la transferencia de propiedad en el país de abanderamiento ... y liquidar el Impuesto de Transmisiones Patrimoniales en España, pues es una venta destinada a surtir efectos en el territorio español.
Nosotros tramitamos transacciones de este tipo constantemente, incluso estoy teniendo casos de españoles que compran barcos de bandera extranjera a españoles y deciden recuperar la bandera española, son pocos pero los hay.
En cualquier caso, si decides mantener la bandera, es lo que he comentado antes, transferencia de propiedad en el país de bandera y pago de ITP aquí.
salud!!!