Evidentemente un filtro ayudará con el problema, pero no lo va a resolver completamente, porque por él pasan los huevos micrscópicos de esas especies que luego anidan dentro. Y entonces ya tenemos el criadero privado con un excelente aporte renovado de agua fresca.
Pienso que la solución puede ser poner una entrada auxiliar con una llave de cierre en una bifurcación en T intercalada en el tubo que va del grifo de fondo a la bomba y por ella meter periódicamente una dosis de lavado/desincrustación según el progreso de los invasores a base de vinagre o incluso clorhídrico (salfuman) diluído. Y rezar para que no ataque mucho a la bomba y lo que va después. Si el lavado es rápido...
Igual que se hace en la tome de motor, para limpiar y endulzar.
Porque me temo que antifouling dentro de tubos finos
En mi filtro de motor me han aparecido atrapados peces y cangrejos que ya me han costado una avería seria, tubo de goma de escape quemado y casi completamente obstruído, con recalentamiento de motor.
Suerte.