Una bateria bien cargada debe marcar 12,8 volt. cuando esta en reposo (sin cargar y sin gastar).
Por cierto, si el cargador carga, la tensión en las baterías debe de ser como mínimo de 13,2 volt. si las baterías están llenas, Y como de unos 14,2 volt. si las baterías no están llenas. Si solo te da algo mas de 12 sin superar los 13 es que ni siquiera te está cargando. Si usaras baterías especiales de gel y se lo indicaras al cargador (Ya sabes, abriéndolo y moviendo los swichts) la tensión de salida debe aumentar a unos 14,6 volt. ya que las de gel necesitan mas "tirón" para cargar.
En tu caso parece que la energía ni siquiera llega a las baterías. ¿se te quemaría algún diodo en el repartidor cuando se fundió el primer cargador? ¿o alguna otra parte del circuito o cableado?
Comprueba la tensión de las baterías cuando no está cargando, después las compruebas cuando carga el alternador del motor y finalmente las compruebas cuando carguen con el cargador y dímelo. Tal vez te pueda orientar. Ah... haz las comprobaciones antes y despues del repartidor y anotalo todo en orden en un papelito para poder cotejar los datos.

Saludos.