Hola Markuay
Como todos los cambios, a veces la información nos llega un poco a cuentagotas.
Yo he confirmado con Bélgica y no debería ser un problema que no tenga CE el barco (salvo que sea un barco muy raro).
En cualquier caso, tanto con la bandera belga como con la holandesa, podrías tener MMSI para tu radiobaliza, DSC, etc. Solamente ten en cuenta que el MMSI tiene que ser de la misma nacionalidad que el pabellón. No puedes conservar el español o sacar uno de otro país que no sea el de bandera (que los he visto, por eso lo comento! )

