Te explico de manera muy resumida y a grosso modo.
LA FP de superior son dos años, y hasta ahora solamente la imparten en la Nauticopesquera de l'Ametlla de Mar (en caso de que estés en Catalunya), se puede hacer por libre, pero hay cierta "leyenda" de que es bastante complicado aprobar de esta manera; cuando acabas tienes el titulo académico y varios certificados que son necesarios para poder navegar; con esto solo podrás navegar de marinero o de alumno, después de un año embarcado ya tienes el Patrón de Altura sin mando (eres oficial), y con un año más ya tienes mando.
Respecto al grado de la FNB son 4 años, y una vez acabado eres alumno; después de un año de alumno eres Piloto de segunda, un año de oficial, Piloto primera; en caso de querer llegar a Capitán tienes que hacer el master.
En caso de que primero hagas la Fp y posteriormente quieras pasar al grado te convalidan aprox. 60 créditos, que es un curso académico entero.
Hacer uno u otro depende de lo que quieras en un futuro, si lo que te tira son golondrinas, pesca, yates pequeños/medianos, charter, etc. mejor FP. Si lo que quieres es mercante haz grado.
Suerte