[TXELFI]

La bomba de inyección casi seguro que no es, no te preocupes. Lo que sí es posible es que se hayan ensuciado los minúsculos orificios de las toberas de los inyectores porque por suciedad de casco y hélice no tienen que oscilar las RPM.
Échale un frasco de limpiainyectores si tienes un tanque de gasoil de unos 50 Lts y si tienes un tanque en cada banda échale un frasco a cada uno.
Independientemente de esto el casco estará muy sucio y probablemente la hélice también, si esto es así cuando pones a toda te tiene que echar humo negro por el escape porque la bajada de velocidad que tienes es tan grande que la hélice es más "dura" para el motor que tiene que moverla, algo parecido a cuando llevas a otro barco de remolque pero en tu caso agravado por la propia suciedad de la hélice.
El humo blanco al arrancar en frío nada tiene que ver con la suciedad de la toma de agua de mar, si una vez que el motor ha alcanzado su temperatura de servicio ha dejado de humear no te preocupes para nada, al arrancar en frío es normal el humo blanco sobre todo en invierno y máxime en ambientes muy húmedos.
Y por último, aparte del limpiainyectores cada año, también un par de veces al año echo 5 Lts de gasolina en cada tanque de 70 Lts de gasoil que llevo a cada banda. Hace 1 mes cuando llevé los inyectores a un banco de pruebas de inyectores me dijo el responsable que las toberas estaban como nuevas porque atomizaban el combustible a la perfección.
Suerte.