Buenas, cofrade:
Yo hice eso mismo con la radio; en el periodo entre la baja de bandera española y el alta de bandera belga desmonté una e instalé la otra. La Licence Radiomaritime la pedí ya con la radio nueva instalada.
De todos modos, un motor no es lo mismo que una radio, y podría verte en problemas si te investigan el historial del barco (francamente, no sé quién podría tener interés en ello, pero hay gente "pa tó"). Mi consejo es que, como el papeleo es más fácil con bandera belga, pidas la baja con el motor viejo y luego tramites el cambio de motor ya con la bandera belga.
Saludos y
