La espuma sirve para que en caso de entrda de agua masiva no se termine hundiendo. Cabría diferenciar entre la de célula abierta y cerrada, pero a la larga como dices, ambas se pueden terminar encharcando.
Si crees que el agua entra por la caja (muy probable) y viendo que en tu barco esta se une al casco donde se ve un relleno de masilla, yo lo que haría 1º es retirar suavemente esta masilla (toda), sanear la fibra de la caja y del casco, y volver a enmasillar y enfibrar con resina epoxi.
Tambien aprovecharía el punto de desagúe (el tapón) que se ve en donde no has cortado y lo uniría a una tubería que llevaría hasta popa (por debajo de linea de flotación) Con esto dejaría un desagúe para la bañera. Una vez hecho esto y antes de colocar el suelo comprobaría que no te entrara agua ni por la caja ni por los tapones. Un saludo y
muchísima suerte