No serías tú el que se quedó tirado el viernes por la tarde a unas millas del cajón del abra.
Supongo que solo llevas un motor, la solución un regulador de carga que te une las dos baterías en el momento que el voltaje sube de 13 voltios para que reciban carga las 2 y en el momento que paras motor y baja el voltaje se desconecta y quedan independientes. Comprueba que no hay ningún cableado que te pueda unir los voltajes por una mala instalación y así no tendrás problemas, si falla una en parado siempre te quedará la otra.