La baja de un pabellón únicamente la puede dar el propietario legitimo del barco, si tienes el contrato de compraventa lo mejor es que te pongas en contacto con alguna gestora Alemana, lo mas fácil es que lo haga el vendedor. Es lo que hago yo siempre que gestiono un compra de otro barco en un país extranjero, no pagar nunca el barco 100% hasta tener la gestión de la baja hecha, no la baja de bandera (que lo la querrán hacer hasta pagar el barco). pero por lo menos tener toda la documentación a falta de cursarla.
Por lo general esta gestión los hacen los brokers.
Saludos,

