Por lo que tengo entendido, si el barco tiene pagados impuestos en Europa (IVA / VAT...) es considerado mercancía UE, y no tienes problemas con aduanas y demás de cara a entrar, salir o pasearte por la Unión Europea. Todo ésto con independencia de la bandera.
Nótese la cantidad de barcos mercantes con bandera de países de conveniencia como Panamá o Liberia que navegan por nuestras aguas. El otro día pasando por el puerto de Santa Cruz de Tenerife vi hasta plataformas petrolíferas con bandera panameña, propiedad de una conocida compañía petrolera española.
