Yo tengo instalado un interruptor en el cable de positivo que va de placas a regulador y puedo desconectarlas cuando pongo en marcha el motor. Es una instalación muy sencilla.

En realidad no hace falta ya que al cargar el alternador, el regulador de placas para la carga desde ellas, pero la electricidad a veces hace cosas raras y yo prefiero no darle ideas.

Sobre la instalación, que en realidad es muy simple, ten en cuenta el grosor de cableado necesario (depende del amperaje y la distancia entre placas y baterías) y asegúrate de que si haces conexiones en el exterior sean estancas de verdad.

Con nociones básicas de electricidad es una instalación fácil de hacer.

Y el regulador, que sea MPTT. Ni lo dudes, ya que su efectividad es espectacularmente mejor.