En los intercambiadores industriales cuando se perfora un tubo lo que se hace es anularlo, sellando los extremos. Se llenará del líquido exterior, pero eso da igual. Disminuye un poco la eficiencia del intercambiador, por lo que sin son varios los que hay que sellar puede que se quede justo...
Cuando hay varios ya se repara entero, cambiando tubos.
Para sellarlos se pone un tapón. Hay varias maneras, depende de la presión a la que trabaje el intercambiador. Desde una chapita soldada, hasta tapones especiales removibles.
Hay que procurar que el material sea el mismo o al menos inerte.
En el caso del intercambiándor del barco, para sellar un tubo, yo creo que un tapón de madera bastaría, ya que la presión es baja. Con la humedad se hincha y queda bien sellado. O un tornillo de plástico o de material compatible de la medida adecuada que puedas roscar el en tubo.

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