No he indagado mucho en la cuestión de porque tiene que estropearse la batería más nueva, aquí mismo en el foro siempre aconsejan que los parques de baterías sean del mismo año, amperaje e incluso marca. técnicamente pues ni idea de que se trata.
Yo también es algo que le he dado vueltas, el porque tengas que cambiar las dos estando una aun funcional, un verdadero despilfarro,

Sería buscar una sistema para mantenerlas aisladas.
El clásico sistema, 2 1+3, off, las conecta en paralelo, por lo que no están aisladas.