Si que tiene utilidad el conmutador (que no interruptor) de 3 posiciones, por ejemplo ponerla en marcha a voluntad en caso de necesidad, pararla...
Si has montado el esquema que indicas,
no debiera hacer cortocircuito, ya que el conmutador, solo maneja el positivo, y el negativo va directo a la bomba.
Fíjate a ver como has cableado el conmutador, y si puedes envía una foto del que has montado.
En este esquema puedes ver mejor como se conecta...