Pues lo primero que debieras montar es un aislador de baterías.
Necesitas dos BMV700 y dos shunt, uno a cada negativo. No hay otra forma de controlar consumos, carga y valores de tensión de dos bancos diferentes.
Ahora te dibujo un esquema de como podrías montarlo.
Fijaros como está conectado el negativo de servicios cuando hay dos baterías en paralelo,
sale de la batería de la que no se coge positivo de salida.
Esquema 2 monitores BMV700...
Configuración BMV700
Calculadora índice de Peukert