Bueno "2pir", a ver si esta configuración te convence.
Tendrás que separar los positivos de salida del conmutador "Perko", que van respectivamente, uno a cuadro de motor y motor de arranque, y otro el positivo de servicios.
Con ella puedes tener el motor sin tensión, pero si en servicios, o todo a la vez, o solo motor. Para caso de emergencia el interruptor 3, une los positivos de ambas baterías.
Esquema con separador de carga e interruptores independientes...