Lo tienes bien montado:

-el filtro está entre el grifo de fondo y la bomba (impeller), o sea, en el lado de succión.

-el antisifón está entre la bomba (impeller) y el intercambiador de calor, o sea, en el lado con presión.

Si se te vacía la parte de la entrada, la causa más probable es que entre aire por el filtro de agua de mar. Comprueba la junta y el apretado de la tapa. Mira también si al funcionar el motor el agua que circula por los tubos (si son transparentes lo puedes ver) lleva burbujas de aire, cosa que indicaría también que aspira aire por el filtro que cierra mal.