[Baronrojo]

Gracias a todos por vuestras respuestas,

Creo que el problema está detectado, lo indico por si ayuda a alguien:

Efectivamente, era un problema de ralentí bajo, lo he ajustado y resuelto.

¿Por que lo hacía en caliente más que en frío?. Solo se nos ha ocurrido una opción: El alternador. Coincide que al arrancar el motor en puerto, las baterias siempre las tengo cargadas, pero al volver y haber navegado a vela no, por lo que demandan más energía del alternador, que, sumado al ralentí bajo hace que el motor se volviese inestable