[Bertie]

Yo soy más bien de Fedora, que a fin de cuentas es una 'beta' de RedHat y es de lo más fiable. Ubuntu (y en general los Debian) no me inspiran mucha confianza.
Tengo instalado OpenCPN 4.8.0, con bastantes plugins y nunca me ha fallado.
Aunque igual no te digo nada nuevo (ya veo que tienes bastante experiencia), este tipo de problemas suele ser por alguna librería incompatible tras la actualización. Suele ayudar arrancar desde línea de comandos y ver si 'escupe' algún error que de alguna pista. O también el comando 'ldd /usr/bin/opencpn' (o donde esté instalado) para ver si hay algún enlace a librerías roto.