Yo una vez me volví loco con una bomba de achique con impeller: montada en la sentina no achicaba (giraba el motor pero no sacaba agua), pero comprobada en un cubo si lo hacía.

La tapa de la bomba estaba desgastada y no hacía suficiente estanqueidad con el impeller. Resultado: puesta en un cubo y con la salida libre hacía circular agua, pero instalada en la sentina y conectada al tubo de salida ya no tenía fuerza para hacer salir el agua.

Te puede pasar lo mismo: la bomba da flujo hasta que la conectas al circuito.

Échale un vistazo a la tapa: es fácil y barato.