Yo pondría el molinete a la batería de mayor capacidad.
¿Qué molinete es? ¿No te han dado también el contactor y el mando?
Ahora te pongo un enlace de como deberías hacer la instalación. Los valores de las capacidades de las baterías no las tengas en cuenta.
Esquema 2 baterías separadas... Actualizado 29-05-24.
Esquema conexiones molinete genérico...