Sobre las filtraciones, el problema de tener filtraciones en esos puntos es que te pudrirá el relleno del sándwich de la cubierta. Lo que se suele hacer es realizar los agujeros de un diámetro superior al del tornillo pasante, rellenar con epoxy y después hacer el agujero del diámetro del tornillo en el epoxy.
Cuando haya alguna filtración, te aseguras que ese agua no te entre hacia el sándwich, que desde mi punto de vista sería el problema.
(cuando digo sándwich me refiero al modo de construcción de esa cubierta, que ha de ser fibra por fuera, madera en medio y fibra por dentro)